适量地吃质量合格的转基因大豆油通常不会对人体造成明显的危害，但如果过量地吃转基因大豆油，则可能有影响营养摄入、导致过敏、诱发高脂血症等危害。
1、影响营养摄入：转基因大豆油是以转基因大豆为原料而制成的食用油，在该过程中，可能会破坏大豆油中原有的营养元素，进而影响机体对营养的摄入，过量食用后可能导致营养不良。
2、导致过敏：如果食用者对转基因大豆油的成分过敏，在过量进食后，容易对机体产生较为明显的刺激，导致免疫系统过度应答，引起严重的过敏反应，常有皮肤红肿、局部瘙痒、咽喉水肿、嘴唇发麻等表现，甚至可能造成过敏性休克。
3、诱发高脂血症：转基因大豆油的脂肪含量较高，如果过量地吃转基因大豆油，容易导致脂肪摄入量超过身体需求，进而大量堆积在体内，不仅可能使身材发胖，还可能使肝脏长期超负荷代谢脂肪，令肝脏代谢脂肪的能力减退，导致血脂异常升高，可能引起高脂血症。
此外，在过量吃质量不合格的转基因大豆油的影响下，可能引起中毒反应，严重危害生命健康。
