引起患者咳嗽、头疼、肌肉酸痛的原因有很多，比较常见的有流行性感冒、新型冠状病毒感染、支气管炎等。建议患者明确具体原因后再针对性治疗。
1.流行性感冒：流行性感冒是由流感病毒引起的呼吸道感染性疾病，患者可出现头痛、发热、咳嗽、肌肉酸痛等多种不适症状。临床对于该病，通常选用抗病毒药物来治疗，患者可遵医嘱服用利巴韦林分散片、磷酸奥司他韦胶囊等，用药期间需注意护理，防止症状加重。
2.新型冠状病毒感染：新型冠状病毒感染是由新型冠状病毒引起的急性呼吸道传染病。该病毒主要通过呼吸道飞沫和密切接触传播，也可通过高浓度气溶胶传播。表现以发热、干咳、鼻塞、咽痛、肌肉酸痛和腹泻等症状。患者可遵医嘱服用对症药物，如对乙酰氨基酚片、布洛芬缓释胶囊等治疗。
3.支气管炎：该病气管、支气管黏膜及其周围组织的慢性非特异性炎症，可出现支气管上皮变性、坏死、脱落。支气管炎急性发作时，可出现高热症状，并伴随头痛、乏力、肌肉酸痛、咳嗽等。对于该病，患者可遵医嘱服用头孢拉定胶囊、盐酸左氧氟沙星胶囊等药物治疗。
另外，喉炎、肺炎等也可引起类似症状发生。建议患者及时就医，查明具体原因后再针对性治疗，不建议擅自用药。