一般情况下，羊水穿刺X染色体缺失，孩子会两性畸形和生殖器发育异常。具体分析如下：
染色体是人体的重要组成部分，如果某一条缺失就可能会出现染色体异常遗传病，可以发生在每一条染色体上。如果羊水穿刺X染色体缺失，孩子一般会出现两性畸形和生殖器发育异常的情况，如果孩子长大，通常不会发育，也不具有性能力。所以一般不建议继续妊娠，建议在医生的指导下采取水囊引产、羊膜腔内注射药物引产等手术终止妊娠。
建议孕妇定期进行产前检查，可以观察胎儿的状态，如果出现异常，可以及时处理。在日常生活中还需饮食清淡，作息规律，适当运动。
