跑完步阴茎疼可能是龟头炎、前列腺炎、附睾炎等原因造成的，患者需要对症治疗。
1、龟头炎：由于患者不洁的性生活、不注重卫生、包皮过长等因素对龟头产生刺激，进而引发龟头炎，在跑步时，对局部产生刺激，会导致出现疼痛的情况。患者可以在医生的指导下使用硼酸洗液、头孢氨苄片、阿莫西林胶囊等药物进行治疗。
2、前列腺炎：前列腺是泌尿系统的重要组织，患者在跑步时，病情发作，进而会出现阴茎疼的症状，同时可能会有尿频、尿多、尿不尽的情况。患者可以在医生的指导下使用前列舒通胶囊、前列回春胶囊、诺氟沙星胶囊等药物进行治疗。
3、附睾炎：由于先天尿道狭窄，若受到外界刺激因素的刺激，会导致输精管逆流，进而诱发附睾炎，疾病发作时，会使得局部有尿意、胀痛，跑步时症状会加重。患者可以在医生的指导下使用头孢他啶片、布洛芬缓释胶囊等药物进行治疗。
综上所述，跑完步阴茎疼可能与龟头炎、前列腺炎、附睾炎等原因有关，患者可以前往泌尿外科、男科就诊，进而明确具体病因，再对症治疗。
