新生儿呼吸不规则的原因包括喉软骨发育不全、呼吸中枢系统发育不全、上呼吸道感染等原因。
1、喉软骨发育不全：新生儿的喉软骨发育尚不完善，常会引起呼吸不规律，呼吸时有声音出现的情况，属于较为常见的现象，一般不做特殊治疗。
2、呼吸中枢系统发育不全：该情况多见于早产儿，因为呼吸中枢系统发育不健全，所以常出现呼吸节律不规则，表现为呼吸深浅交替、快慢不均等情况。建议再观察一段时间，如果是早产儿，建议放进保温箱中，避免引起不良反应。
3、上呼吸道感染：如果没有注意身体保暖，可能会引起上呼吸道感染，导致咽喉黏膜水肿，出现咳嗽、呼吸不规律等情况。建议适当喂水缓解，也可以遵医嘱使用小儿止咳糖浆、小儿黄龙颗粒等药物治疗，起到清肺止咳的作用。
除上述常见原因之外，还可能是咽炎、支气管炎、肺炎等因素导致的，建议及时就医治疗。