一般情况下，早上起来上腹部疼痛可能是十二指肠溃疡、慢性胃炎、胆囊炎等疾病导致的，不同的病因建议采取不同的治疗方式。具体分析如下：
1.十二指肠溃疡：十二指肠溃疡通常指十二指肠在高胃酸、胃蛋白酶的侵袭下，防御失衡，消化自身黏膜而形成的局部炎性缺损，典型症状为空腹时上腹痛，发作呈现出一定的周期性、节律性，所以早上起来上腹部疼痛可能是十二指肠溃疡导致的。患者一般可以在医生的指导下使用奥美拉唑、兰索拉唑、泮托拉唑钠等药物来治疗。另外建议十二指肠溃疡患者避免食用辛辣的食物，例如洋葱、辣椒、芥末等，以免加重病情。
2.慢性胃炎：慢性胃炎通常指由多种病因引起的慢性胃黏膜炎症病变，患病率一般会随年龄增长而增加，常表现为上腹部不适或疼痛、餐后饱胀、食欲缺乏、泛酸、恶心等，所以早上起来上腹部疼痛可能是慢性胃炎导致的。患者一般可以在医生的指导下使用克拉霉素、阿莫西林、甲硝唑等药物治疗，平时还要注意休息，避免暴饮暴食，避免食用过硬、过酸、过热的食物，进食宜细嚼慢咽，定时定量，有时还需要遵循医嘱短期禁食。
3.胆囊炎：胆囊炎是由胆囊管阻塞和细菌侵袭引起的胆囊炎症，常表现为右上腹疼痛、恶心、呕吐等，所以早上起来上腹部疼痛可能与胆囊炎有关。患者一般可以在医生的指导下使用盐酸克林霉素、消旋山莨菪碱、间苯三酚等药物来治疗，严重时还可以通过胆囊切除术、胆囊造口术等手术进行治疗。
