通常情况下，吞咽口水喉咙有咯噔声，长期下来是否有关系取决于其原因。如果吞咽口水喉咙有咯噔声是正常现象，那么长期下来一般没有关系；如果吞咽口水喉咙有咯噔声是喉软骨膜炎引起的，那么长期下来可能有关系。具体情况分析如下：
1.没有关系：吞咽口水的时候，喉咙的肌肉和筋膜、软骨与关节之间可能会相互摩擦，从而会出现咯噔声，此种情况比较正常，不会损伤咽喉，长期下来通常没有关系。
2.有关系：如果吞咽口水喉咙有咯噔声是喉软骨膜炎引起的，长期下来可能是有关系的，患者需要积极进行治疗，可以遵医嘱使用药物来治疗，比如布洛芬缓释胶囊、阿莫西林胶囊、双氯芬酸钠肠溶片等。
