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六神丸和蓝芩口服液的区别是功效不同，作用不同。
1、功效不同：六神丸和蓝芩口服液属于生活当中比较常见的药物，但是两者药物之间的功效并不相同，六神丸在使用之后主要可以起到清热解毒的功效，蓝芩口服液主要具有活血化瘀的作用。
2、作用不同：六神丸和蓝芩口服液使用之后的作用不相同，六神丸但可以用于治疗肺部疼痛，对于头痛治疗效果也是比较好的，但是蓝芩口服液主要可以用于治疗咽喉炎，有利于咽喉部位所出现疼痛症状可以得到明显改善。