心率变异是指心率变异性，当心率变异性为39毫秒时，一般是不正常现象，可能是心律失常、冠状动脉粥样硬化性心脏病等疾病引起的。
心率变异性是指逐次心跳周期差异的变化情况，其含有神经体液因素对心血管系统调节的信息，从而判断其对心血管等疾病的病情及预防。进行该项检查时，一般有SDNN、SDANN等指标，其中SDNN的正常值为(141±39)ms；SDANN的正常值为(127±35)ms。因此，根据上述指标的正常范围进行判断，心率变异性39毫秒是一种不正常的情况，患者需要积极配合医生进行治疗。
如果是心律失常引起的，患者可在医生的指导下服用盐酸普罗帕酮片、盐酸胺碘酮片等药物进行治疗。如果是冠状动脉粥样硬化性心脏病引起的，患者可遵医嘱服用硝酸异山梨酯缓释片、酒石酸美托洛尔缓释片等药物进行治疗，必要时可通过经皮冠状动脉介入治疗、冠脉搭桥术等手术进行治疗。
当患者进行检查时得到上述结果，需要进一步完善动态心电图、超声心动图、冠状动脉CT等检查，以明确诊断并对症治疗。平时注意保持规律的作息，避免熬夜；保持饮食营养均衡，避免吃高糖、油腻的食物。