孩子指甲有坑坑洼洼可能是甲营养不良、甲癣、手足口病恢复期、银屑病累及指甲、咬甲癖等原因导致的，家长需要及时带孩子到医院就诊，并且配合医生对症治疗。
1、甲营养不良：可能由于孩子营养摄入不足，影响指甲正常生长，导致指甲出现坑洼。家长可以按照医嘱给孩子使用人表皮生长因子凝胶(酵母)、尿素乳膏等药物补充营养，改善指甲状况。
2、甲癣：皮肤癣菌感染指甲引起甲癣，除了指甲可能变厚、变色外，也会出现表面不平整有坑洼的情况。家长要注意孩子手部卫生，防止交叉感染，可以按照医嘱给孩子使用硝酸咪康唑乳膏、环吡酮胺乳膏等药物涂抹指甲，起到抗真菌的作用。
3、手足口病恢复期：孩子患手足口病后，在恢复期可能会出现指甲脱落、新甲有坑洼等现象。这是因为病毒感染影响了指甲的生长，一般会逐渐恢复。
4、银屑病累及指甲：若孩子患有银屑病，病情累及指甲时，指甲会出现顶针样凹陷，也就是有许多小坑洼。家长可以按照医嘱给孩子使用卤米松乳膏、卡泊三醇搽剂等，缓解银屑病对指甲的影响。
5、咬甲癖：有些孩子会有咬指甲的习惯，长期咬甲会使指甲表面损坏，出现坑洼。家长要引导孩子纠正这个习惯，当发现孩子有咬甲行为时，可以通过转移注意力等方式制止。家长要注意定期给孩子修剪指甲，保持指甲适当长度，避免指甲受伤。
