通常情况下，阿卡波糖和二甲双胍相比，一般阿卡波糖的副作用大。具体分析如下：
阿卡波糖可以使得肠道葡萄糖的吸收减缓，从而缓解餐后高血糖，达到降低血糖的作用。长期服用，可降低空腹血糖和糖化血红蛋白的浓度。但是如果使用不当，可能会导致腹胀、腹泻和腹痛等消化道症状，还可能会引起肝细胞性肝损伤。二甲双胍为降血糖药，可降低2型糖尿病患者空腹及餐后高血糖，可使HbAlc下降1%～2%。一般副作用是胃肠道不适，如恶心、呕吐、腹痛。所以通常来说，阿卡波糖和二甲双胍相比，一般阿卡波糖的副作用大。
建议患者在医生的指导下使用药物，以免药物使用不当影响身体健康和病情恢复。
