3岁宝宝半夜咳痰呕吐可能是过敏性咳嗽、支气管炎、肺炎的引起的，具体病因需要到医院做检查明确。
1、过敏性咳嗽：三岁宝宝半夜出现咳嗽呕吐，可能是接触了过敏性物质，比如动物的毛发或者花粉容易产生过敏性咳嗽，需要使用抗过敏药物治疗，比如盐酸西替利嗪片、氯雷他定片和马来酸氯苯那敏片。
2、支气管炎：支气管炎主要是支气管的部位受到了细菌感染，黏膜会有充血和水肿，也会有咳嗽呕吐症状，需要使用阿莫西林胶囊和牛黄蛇胆川贝液治疗。
3、肺炎：肺炎主要是肺部的黏膜出现了细菌感染，出现咳嗽或者呕吐的症状，主要通过静脉输液来促进炎症的消失。