早上起来肾疼，可能是肾盂肾炎、肾结石等疾病引起的，需要根据病因对症治疗，具体分析如下：
1.肾盂肾炎：早上起来肾疼可能是肾盂肾炎引起的，一般还会出现尿痛、尿急等不适症状。可以在医生的指导下服用左氧氟沙星片、肾炎灵颗粒、头孢呋辛酯片等药物进行治疗。
2.肾结石：早上起来肾疼，可能是肾结石移动的时候，尖锐部分刮擦到肾周围组织引起的，有时还可能会伴有呕吐、恶心、腹胀等不适的症状。可以在医生的指导下服用肾石通颗粒、排石颗粒、金钱草颗粒等药物进行治疗，有利于促进肾结石的排出。如果服用药物后没有明显的效果，就需要通过肾结石手术取出肾结石。
