手淫通常是指自慰。自慰后肾疼可能是剧烈运动、肌肉劳损、肾小球肾炎、肾盂肾炎、肾结石等因素导致的，需要对症处理。
1、剧烈运动：若患者在自慰前剧烈运动，可能会导致身体疲劳，患者自慰后有可能感觉肾脏部位出现疼痛。建议患者适当休息，控制运动强度。
2、肌肉劳损：肌肉劳损是由肌肉长期、持续保持同一姿势或动作引起，自慰后有可能导致腰部肌肉过度紧张，出现疼痛、酸胀等症状。需要遵医嘱使用布洛芬缓释胶囊、塞来昔布胶囊等药物来减轻疼痛。
3、肾小球肾炎：如果患者患有肾小球肾炎，自慰后可能会导致患者过度疲劳，加重肾小球肾炎的症状，出现剧烈疼痛、血尿、蛋白尿等症状。建议遵医嘱使用氯沙坦钾氢氯噻嗪片、醋酸泼尼松龙片等药物进行治疗，能促进排尿，减轻炎症。
4、肾盂肾炎：如果自慰时没有做好清洁卫生，导致病原体滋生，当病原体进入肾盂以后，就可能诱发肾盂肾炎，引起疼痛、发热、寒战等症状。建议遵医嘱使用盐酸左氧氟沙星胶囊、注射用头孢曲松钠等药物来消除炎症。同时要注意做好生殖器周围清洁干燥，避免细菌滋生。
5、肾结石：如果患者本身存在肾结石，自慰后肾结石在肾脏内活动，可能会刺激肾脏内壁黏膜，导致肾脏部位出现疼痛症状。建议遵医嘱使用排石颗粒、金钱草颗粒等药物进行治疗，能促进肾结石排出。
若不适症状比较严重，建议患者及时前往医院进行检查，针对病因进行治疗。
