咪喹莫特和氟尿嘧啶一般能同时用，遵医嘱用药能够起到较好的治疗效果。
咪喹莫特常见剂型为乳膏剂，属于一种免疫调节药，常用于治疗成人外生殖器和肛周尖锐湿疣。咪喹莫特能够在用药局部诱生多种细胞因子及相关产物，从而产生免疫调节和间接抗病毒作用。氟尿嘧啶的常用剂型为注射剂，其是脱氧核苷酸合成酶抑制剂，通过阻断脱氧尿苷酸向胸腺嘧啶的转化，从而干扰DNA的生物合成，起到抗增生和抗病毒的作用。
通常咪喹莫特和氟尿嘧啶能同时使用，一般不会发生不良反应，也不会影响皮肤对于药物的吸收和利用。并且两种药物同时使用，能够治疗扁平疣，有利于增加抗增生、抗病毒及免疫调节作用，使皮损消退明显加快，进而达到较好的治疗效果。但需要注意的是，有研究证明，部分患者用药后有皮肤刺激性发红、灼痛等症状，还伴有程度不一的色素沉着，这些症状在停止用药后可逐渐消失，患者不用过于担心。
患者应在医生的指导下使用咪喹莫特和氟尿嘧啶来治疗，如果患者对这两种药物过敏应禁用，以免发生不良反应。
