一般来说，巧囊和囊肿在病因、成分、症状、对生育影响、治疗方式等存在区别。
1、病因：巧囊即卵巢子宫内膜异位囊肿，是子宫内膜异位症的一种表现。子宫内膜组织出现在卵巢内，随着月经周期反复出血，形成囊肿。而囊肿是一个比较宽泛的概念，其形成原因多样，可能是生理性的，如黄体囊肿是排卵后形成的；也可能是由于炎症刺激、卵巢肿瘤等病理性因素导致的。
2、成分：巧囊内主要含有陈旧性血液，这些血液呈暗褐色，类似巧克力样，因此得名。囊肿的成分则根据其类型而不同，如浆液性囊肿内主要是清亮的浆液，黏液性囊肿内含有黏液，而皮样囊肿内可能含有毛发、牙齿等组织。
3、症状：巧囊患者常见的症状是进行性加重的痛经，疼痛程度和时间因人而异，还可能伴有性交痛、不孕等。囊肿的症状取决于其大小、位置和性质。较小的囊肿可能没有明显症状，较大的囊肿可能会引起腹部胀满、疼痛，压迫周围组织时还可能出现尿频、便秘等症状。
4、对生育影响：巧囊会对生育产生较大影响，因为其会影响卵巢功能和盆腔环境，导致排卵异常、输卵管粘连等问题，降低受孕概率。囊肿是否影响生育要看具体情况，生理性囊肿一般不影响生育，良性肿瘤性质的囊肿如果体积较大或者位置特殊可能会影响生育，恶性囊肿则会严重影响生育并且危及生命。
5、治疗方式：巧囊的治疗主要根据患者的年龄、症状、生育要求等因素综合考虑。对于症状较轻、有生育要求的患者，可能先采取药物治疗，如使用孕三烯酮等药物来缓解症状并控制囊肿生长；对于病情较重、囊肿较大或者没有生育要求的患者，可能需要手术治疗。囊肿的治疗则要区分是生理性还是病理性。生理性囊肿一般观察即可，病理性囊肿如果是炎症性的，可能需要抗炎治疗，如使用抗生素；如果是肿瘤性的，可能需要手术切除并根据肿瘤性质进一步治疗。
如果发现卵巢有囊肿样结构，建议及时就医。医生会通过详细检查，如超声检查、血液检查等来确定是巧囊还是其他类型的囊肿，以及评估囊肿的性质和严重程度。根据诊断结果，医生会制定合适的治疗方案，患者要严格遵医嘱进行治疗和定期复查。
