粪肠球菌肺炎为肠球菌肺炎的一个类型，属于细菌性肺炎，可以遵医嘱使用的药物包括青霉素类药物、头孢菌素类药物、四环素类抗生素、喹诺酮类抗生素等。
1.青霉素类药物：该药物是一种常见的抗生素，如注射用青霉素钠、氨苄西林胶囊等，由于其中含有β-内酰胺，可抑制细菌的细胞壁合成达到抗菌效果。若是出现粪肠球菌肺炎，可遵医嘱使用该药物。
2.头孢菌素类药物：该类药物是以天然头孢菌素C作为原料，经半合成改造其侧链而得到的一类抗生素，如头孢呋辛酯片、头孢克洛颗粒等，通常可以用于治疗粪肠球菌肺炎，抑制粪肠球菌生长。
3.四环素类抗生素：如盐酸多西环素片、四环素片等，能对敏感细菌起到较好的抑制效果，临床上对于粪肠球菌所引起的肺炎病症，也有一定的疗效。
4.喹诺酮类抗生素：该类药物是人工合成的含4-喹诺酮基本结构的抗菌药，具有较强抑菌消炎效果，如盐酸左氧氟沙星胶囊、氧氟沙星葡萄糖注射液等。临床上可以抑制粪肠球菌生长，帮助减轻患者的临床症状。
由于该病本身较为少见，同时单纯用药大多效果不佳，患者通常需在医生指导下联合使用上述药物，可较好地抑制细菌增殖，能够帮助缓解临床症状。