三个月婴儿脑袋发热可能是正常现象、反复摩擦、环境温度过高、普通感冒、扁桃体炎等原因引起的，需要积极进行对症治疗。
1、正常现象：婴儿的血液循环速度比较快，大脑的血液循环更快，脑袋的温度会比身体的温度高，属于正常的现象，一般不需要特殊治疗。
2、反复摩擦：如果婴儿经常在枕头上打滚，就可能会导致脑袋被反复摩擦，引起脑袋发热的症状，一般不需要特殊治疗，让婴儿多休息即可。
3、环境温度过高：如果婴儿所处的环境温度比较高，就可能会导致脑袋温度升高，一般不需要特殊治疗，家长及时改善婴儿所处的环境即可。
4、普通感冒：该疾病可能会刺激免疫系统，刺激炎症因子释出，可能会出现发热、咳嗽等症状，建议家长遵医嘱给婴儿服用小儿氨酚黄那敏片、小儿清感灵片等抗感冒的药物进行治疗。
5、扁桃体炎：该疾病可能会引起扁桃体炎症，可能会出现咽喉肿痛、脑袋发热等症状，建议家长遵医嘱给婴儿服用头孢克肟颗粒、阿莫西林颗粒等消炎的药物进行治疗。
在治疗期间家长需要注意保持婴儿脑袋周围的清洁和卫生，给婴儿多喝水，有利于身体的恢复。
