怀孕39周小腹一会疼一会不疼可能是子宫增大、先兆临产、饮食不节等所致，建议通过适当休息、待产、改善饮食等进行处理。
1.子宫增大：怀孕39周属于孕晚期，胎儿通常比较大，会导致子宫不断增大，这会压迫胃肠道，导致小腹时疼时不疼。建议注意休息，避免久站、长时间运动，以免加重不适。
2.先兆临产：如果阴道同时排出含有血液的黏液白带，小腹阵发性疼痛，可能是先兆临产引起不规则阵痛所致。这种情况需要尽快收拾备产用品，去医院待产。
3.饮食不节：怀孕39周时，部分孕妇为了给胎儿补充营养，会大量进食鸡蛋、牛肉等高蛋白食物，这可能会导致消化不良，使腹部出现阵发性疼痛。建议孕妇调整饮食，避免暴饮暴食，以免加重胃肠负担。
此外，若是孕妇患有肠道菌群失调症、慢性肠炎等疾病，也可能会导致小腹不适，建议及时就医。
